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0代码也能搞生信分析,Excel轻松搞定数据处理,赶紧收藏

在做生信分析论文的时候,不少童鞋都会遇到处理数据的问题——“我明明和视频里操作处理一样为什么会用不了呢?”——今天我们来详细地讲解常用的处理数据和Excel的技巧以及其中会遇到的问题。使用WPS或者其他表格工具的同学们也不用担心,虽然不同软件会存在部分操作上差异,但功能上八九不离十都能够完成。

脱离笨重的编程语言,0代码处理数据,实现真正的“The Less The More”。视频中的资料和链接放在末尾,小伙伴可以自取。

1 填补、剔除等数据预处理
写生信论文的时候,在下载完数据后,往往会发现自己获得的表达谱或是其他数据集中包含大量的缺失值、冗余值或是统计分析中无意义的值,这就需要我们来对数据进行处理。这里提供的方法是来自sangerbox的几样工具来处理数据。无论是GEO芯片还是TCGA高通量数据数据一网打尽。

2 vlookup及常用函数教程

Excel中的函数功能强大大家一定都听说过,不少功能其实和我们平常使用的代码是异曲同工之妙,比如求和、求均值等等,还可以自行下载大神们打包好的插件,就像是R语言中的library(“大神制作”),快速提高我们的工作效率。

这里就不展开,主要讲解一下基础的函数和vlookup函数在处理我们常用的表达谱等数据中的作用和用法,vlookup!yyds!

3 数据集处理

学会了函数的功能,当然就是应用。除了数值上的处理,我们还需要对数据集包括简单分类功能、基本统计分析功能、交集并集等操作,选出需要的样本/组织及需要的表达值/数值。

4 去批次效应

针对来自多个数据集的数据,因为存在低通量批次不同、空间时间等差异,我们一般需要进行去批次效应后才能合并使用,这里还需要sangerbox平台中的工具来进行操作。

0代码也能搞生信分析,Excel轻松搞定数据处理,赶紧收藏,真的不用代码!

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