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1.1信息网络系统

你会用什么方法研究蛋白的弱/瞬时相互作用?

蛋白互作在细胞生命活动中发挥着关键作用,并且在不同的时空层面上参与多种细胞学过程,例如,调控细胞周期、蛋白质的合成与分泌、信号转导与代谢等。因此研究蛋白互作对于理解分子调控网络至关重要。目前大家常用的寻找蛋白互作研究手段主要有酵母双杂交(Y2H)筛选和免疫共沉淀结合质谱(IP-MS)分析。使用Y2H研究互作蛋白时需要构建合适的cDNA文库,这一步往往费时费力,并且酵母细胞作为单细胞真核生物与高等真核多细胞生物如植物细胞之间存在显著差别。在大多数情况下,免疫共沉淀(Co-IP)因为不能有效地捕获瞬时或较弱的蛋白相互作用而存在一定的限制。基于以上原因,科学家们开发出了一种新的研究相互作用的蛋白质组学技术——邻近标记技术(Proximity labeling, PL),它不仅无需构建文库或使用抗体,还对疏水性和低丰度蛋白的互作蛋白鉴定以及弱/瞬时互作蛋白的分析具有独特的优势(Yang et al., 2021)。该技术在2017年被首次应用在水稻原生质体中后,陆续在本氏烟、拟南芥、番茄中也有相关报道,今天伯小远就带领大家一起来详细学习一下什么是邻近标记技术吧~

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